Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Znhit3Q9CQK1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms