Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms