Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms