Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ClpsQ9CQC2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ClpsQ9CQC2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms