Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lyrm1Q9CQB7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms