Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg3Q9CPX6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms