Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms