Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep41Q99NF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms