Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms