Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1b4Q99ME6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms