Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca3Q99M54 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms