Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms