Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dctn2Q99KJ8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms