Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlgn1Q99K10 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms