Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lims1Q99JW4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms