Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlcd1Q99JT6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms