Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Krcc1Q99JT5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krcc1Q99JT5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krcc1Q99JT5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krcc1Q99JT5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krcc1Q99JT5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krcc1Q99JT5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Krcc1Q99JT5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Krcc1Q99JT5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms