Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl22Q99JN2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klhl22Q99JN2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms