Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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