Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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SptssbQ925E8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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