Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TardbpQ921F2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms