Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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