Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms