Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab29Q91YQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab29Q91YQ1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab29Q91YQ1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab29Q91YQ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab29Q91YQ1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rab29Q91YQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab29Q91YQ1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms