Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms