Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsl6Q91WC3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms