Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms