Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms