Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mterf3Q8R3J4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms