Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms