Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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