Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z9

Pom121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, mousemouse

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pom121Q8K3Z9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pom121Q8K3Z9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pom121Q8K3Z9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms