Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms