Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms