Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms