Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cldn34c1Q8K193 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34c1Q8K193 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Cldn34c1Q8K193 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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