Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms