Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms