Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms