Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms