Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1rbQ8CFG9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms