Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ercc8Q8CFD5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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