Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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