Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrn3Q8CBC6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrn3Q8CBC6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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