Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
4930507D05RikQ8C9C9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms