Protein–RNA interactions for Protein: Q8C886

Plekhn1, Probable pleckstrin homology domain-containing family N member 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhn1Q8C886 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plekhn1Q8C886 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms