Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms