Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ubqln3Q8C5U9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ubqln3Q8C5U9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln3Q8C5U9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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