Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssuh2Q8C3L1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms