Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms